MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	ATA	3	9	3	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000854	TC	3	6	198	203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000854	TA	4	8	2248	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000854	TAT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000854	TAT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000854	AGGA	2	8	2892	2899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000854	AGA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000854	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000854	TTA	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000854	ATA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000854	AGAA	2	8	3085	3092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000854	GGT	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000854	ATA	2	6	3164	3169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000854	CCA	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_000854	TAT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000854	GAAA	3	12	3234	3245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000854	ACA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000854	TAA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000854	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000854	GAT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000854	TAT	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000854	CCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_000854	CAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000854	GAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000854	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000854	AT	3	6	3617	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000854	AG	3	6	3629	3634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000854	TTAT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000854	CAA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000854	ATA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000854	TA	3	6	3825	3830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000854	TAATC	2	10	3835	3844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_000854	AGT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000854	CAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_000854	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000854	GTG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000854	CCG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_000854	TA	3	6	5561	5566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000854	ACA	2	6	5639	5644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000854	GCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000854	CA	3	6	5708	5713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_000854	CAG	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000854	TTCA	2	8	6083	6090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_000854	TGT	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000854	GTT	2	6	6131	6136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000854	GGAT	2	8	6140	6147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000854	GTG	2	6	6148	6153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000854	CTT	2	6	7831	7836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_000854	CAT	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_000854	TAT	2	6	7915	7920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000854	AACAA	2	10	7930	7939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_000854	AT	3	6	8010	8015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000854	ACTAT	2	10	8032	8041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000854	GTA	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000854	TTA	2	6	9938	9943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000854	TGG	2	6	9980	9985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000854	ACG	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000854	AGCA	2	8	11714	11721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_000854	TA	3	6	11754	11759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000854	CTC	2	6	11781	11786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_000854	GA	3	6	11825	11830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000854	G	6	6	11855	11860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000854	CGG	2	6	11915	11920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_000854	ATG	2	6	11923	11928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000854	ACTTC	2	10	11964	11973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_000854	TC	3	6	11972	11977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_000854	AGG	2	6	12082	12087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000854	GA	3	6	12179	12184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000854	ACT	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_000854	T	6	6	12246	12251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000854	TA	3	6	12280	12285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000854	TA	3	6	12287	12292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000854	GGAGA	2	10	12322	12331	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000854	C	6	6	13914	13919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_000854	GTC	2	6	15332	15337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000854	ACC	2	6	15915	15920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_000854	GAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000854	GT	3	6	20896	20901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000854	AGC	2	6	22418	22423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_000854	AT	3	6	22454	22459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000854	TA	4	8	22485	22492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000854	TGG	2	6	22496	22501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000854	TTGC	2	8	26847	26854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_000854	AC	3	6	26871	26876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000854	AT	3	6	26901	26906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000854	TA	3	6	26912	26917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000854	CTAT	2	8	26928	26935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_000854	GAA	2	6	26949	26954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000854	AATA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000854	GA	3	6	31278	31283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000854	GAA	2	6	31303	31308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000854	CACT	2	8	32892	32899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_000854	CCA	2	6	33594	33599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_000854	ATA	2	6	33624	33629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000854	TAA	2	6	33640	33645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000854	AGG	2	6	34978	34983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000854	AAT	2	6	41133	41138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000854	AAG	2	6	41165	41170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000854	TGG	2	6	45023	45028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000854	CTA	2	6	45869	45874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_000854	GACA	2	8	45938	45945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000854	TCCAGA	2	12	46441	46452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_000854	TCCAT	2	10	46468	46477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_000854	TACA	2	8	46486	46493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_000854	TG	3	6	46513	46518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000854	CTA	2	6	46529	46534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000854	AAAT	2	8	46536	46543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000854	AG	3	6	46611	46616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000854	ATC	2	6	47116	47121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_000854	GGT	2	6	47702	47707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000854	TA	3	6	47832	47837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000854	T	6	6	47839	47844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000854	CTT	2	6	47857	47862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_000854	TGC	2	6	47891	47896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_000854	TTAG	2	8	47911	47918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000854	TC	3	6	47919	47924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000854	CCCT	2	8	48619	48626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_000854	CTC	2	6	48648	48653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_000854	CT	3	6	48721	48726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_000854	TAA	2	6	48734	48739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000854	AGGA	2	8	48856	48863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000854	CCT	2	6	48881	48886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_000854	ATA	2	6	49066	49071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000854	G	6	6	49159	49164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000854	GC	3	6	49167	49172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000854	GTG	2	6	49225	49230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000854	C	6	6	50357	50362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_000854	GCA	2	6	53120	53125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_000854	TAA	2	6	53227	53232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000854	TAG	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000854	GTG	2	6	54037	54042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000854	ATA	2	6	57778	57783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000854	ACC	2	6	58542	58547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_000854	GAAAG	3	15	58558	58572	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000854	ACC	2	6	59274	59279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_000854	GCA	2	6	59315	59320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000854	CA	3	6	59319	59324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000854	TACT	2	8	59846	59853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_000854	AT	3	6	59879	59884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000854	GGT	2	6	59898	59903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000854	GTGA	2	8	60745	60752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000854	GTTT	2	8	60803	60810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000854	G	6	6	60855	60860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000854	TCC	2	6	61847	61852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_000854	TCA	2	6	61863	61868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_000854	CAG	2	6	61875	61880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_000854	CTC	2	6	61946	61951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_000854	TTA	2	6	61979	61984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000854	GTC	2	6	62004	62009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_000854	AT	3	6	62020	62025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000854	TAT	2	6	62041	62046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000854	TGG	2	6	62051	62056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000854	GAA	2	6	62139	62144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_000854	CCTAGG	2	12	62159	62170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_000854	TTC	2	6	62300	62305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_000854	ATC	2	6	62335	62340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_000854	CGT	2	6	62364	62369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_000854	CA	4	8	62519	62526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_000854	GGT	2	6	62534	62539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_000854	GT	3	6	62538	62543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_000854	GT	3	6	64002	64007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_000854	TCC	2	6	66555	66560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_000854	TA	3	6	67629	67634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_000854	TAC	2	6	67719	67724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_000854	ATT	2	6	67771	67776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_000854	GCT	2	6	67794	67799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_000854	TAA	2	6	67828	67833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_000854	CAAC	2	8	67849	67856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_000854	TA	3	6	67915	67920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_000854	ATATT	2	10	67937	67946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_000854	TCA	2	6	69170	69175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_000854	CGG	2	6	69224	69229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_000854	GTAT	2	8	72127	72134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_000854	GAG	2	6	72137	72142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_000854	GTA	2	6	72265	72270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_000854	CCT	2	6	72299	72304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_000854	TTA	2	6	72483	72488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_000854	TAT	2	6	72489	72494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_000854	TCC	2	6	72548	72553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_000854	GT	3	6	72564	72569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_000854	GCCT	2	8	72571	72578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_000854	TA	3	6	72582	72587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_000854	AGG	2	6	72642	72647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_000854	TGG	2	6	72689	72694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_000854	CTT	2	6	72711	72716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_000854	TGG	2	6	72719	72724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
187	NC_000854	TA	3	6	72745	72750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_000854	CTGG	2	8	72751	72758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_000854	TAG	2	6	76098	76103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_000854	AG	3	6	84774	84779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_000854	TTA	2	6	84978	84983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_000854	C	6	6	86063	86068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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276	NC_000854	GTAAT	2	10	127305	127314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_000854	ACC	2	6	129773	129778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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282	NC_000854	TAA	2	6	133115	133120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_000854	TGG	2	6	133162	133167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_000854	TA	3	6	137262	137267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_000854	TA	3	6	137277	137282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_000854	ATA	2	6	137367	137372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_000854	GGCCGG	2	12	140068	140079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_000854	TG	3	6	191465	191470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_000854	ACC	2	6	191625	191630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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446	NC_000854	GCT	2	6	192325	192330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_000854	CTT	2	6	192475	192480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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